Wenn du dsa Uploadformuar auf der Webseite genutzt hast, hast du nur eine virtuelle Struktur. Die Bilder liegen alle im upload Ordner.
Wenn du die Bilder per FTP hochgeladen hast, sollten diese im galleries Ordner landen.
Backup:
Einfach das gesamte Piwigo _data Ordner sichern. Unter _data/i sollte alles liegen. Dazu muss du auch die DB sichern.
Es gibt glaube ich auch im engl. Forum ein Script das mal geschrieben wurde (ka was da der Stand ist).