Welche der Listen? Im Tab Synchronisierung oder Seitenverwaltung?
Alles was du da drunter siehst (erster Tab) sind Ordner auf deiner Platte und da liegen deine Bilder drin.
Auf der zweiten Seite ist in der Grundeinstellung nur ein Ordner drin. Man kann da mehr hinzufügen (wenn man unterschiedliche Verzeichnisse hat) oder man kopiert alles in das eine Verzeichnis rein und baut dann eine Struktur dadrunter auf.
Alternativ gibt es auch die Virtuellen Alben. Da organisiert Piwigo alles. Die Bilder werden dann nach Datum usw. in einem anderen Verzeichnis sortiert. Man findet diese aber nicht mehr in der Sortierung auf der Platte und eine Wiederherstellung ist schwieriger.

Das kannst du nur, wenn du die Ordner, die Bilder sollten dann auch umkopiert worden sein in das virtuelle Verzeichnis (VOHER ÜBERPRÜFEN, unter _data, upload i oder so liegen alle Bilder) einfach löschst. Das sind alles Verzeichnisse unterhalb von galleries.

Starte mal unter Seitenverwaltung den Sync. Dann liest er die Struktur neu ein.

Ach, was da auch aufgelistet ist, sind die Alben die generiert wurden. Wie sieht es denn in der Albenübersicht aus? Die ggf. die leeren mal löschen.